2021年6月24日， 世界海關組織第22屆亞太地區海關署長視頻會議上，中國海關提出在南京海關實驗室承辦世界海關組織亞太地區海關實驗室的提案，獲得會議通過。同日，世界海關組織(WCO)秘書長和中國海關總署(GACC)署長倪嶽峰簽署了在中國建立區域海關實驗室(RCL)的諒解備忘錄，正式授予南京海關實驗室這一地位。
區域海關實驗室作為世界海關組織重要的區域性機構，在加強海關實驗室的國際交流與合作、提升稅收成效、促進貿易便利與安全、保護生態環境等領域發揮著重要作用。
在南京海關實驗室承辦世界海關組織亞太區域海關實驗室，體現了中國海關不斷深化多邊國際合作、深度參與世界海關組織事務的進程，是中國海關世界影響力不斷擴大的體現。目前，中國海關已經承辦了世界海關組織由成員獨立運作的全部3類區域性機構，即：培訓中心、訓犬中心、海關實驗室。
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